Gromacs程序正确性验证公告
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Gromacs程序的正确验证:
允许的误差范围:
离子通道算例:温度,总能量3%的相对误差,压强不做要求。
木质纤维算例:温度,总能量3%的相对误差,压强10%的相对误差。
注意:
以题目公告中给出的编译参数的结果作为标准结果。
温馨提示 : 允许混合精度优化。
离子通道算例没有进行控压耦合,压强没有参考价值。
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组委会老师你好:请问一下,温馨提示的允许混合精度优化 是指 我最终可以以混合精度版本提交,对双精版本不做要求对么?
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@xiao灰灰 允许用单精度做优化
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您好,请问验证中提到的输出结果的"温度误差、总能量、压强误差"是指ener.edr文件中的如图所示三项吗?
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老师你好,请问一下 压强误差 是指哪一个参数?是energies下的pressure(bar) 还是 pres.DC(bar)? 还是Pressure下的九个值?
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老师您好
我们使用了未修改的源程序运行多次后
发现压力值也会出现较大的不同
如图所示两次运行后的压力值区别:
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@popo 谢谢老师,另外想问一下老师,因为在ion离子通道的算例下,pcoupl设置为No,为不进行压力耦合,不去控制系统压力。所以是否会影响系统的压强误差波动较大?
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